При использовании в качестве основного метода сканирующей электронной микроскопии, ауторадиографическая картина выглядит иначе, чем при ТЭМ. Зерна восстановленного серебра выявляются в виде ярко светящихся точек над ядрами, которые находятся в фазе синтеза ДНК, т.е. в S-фазе #1, #2, #3, #4. Этот методический подход позволяет судить об общей доле клеток, находящихся в S-фазе (пролиферативного пула или доли делящихся клеток) в данной клеточной популяции. На приведенной иллюстрации показан фрагмент эндотелиальной выстилки аорты, находящийся рядом с зоной повреждения эндотелиального пласта. Клетки, находящиеся здесь, как правило, не мигрируют в сам участок повреждения. Они интенсивно делятся с тем, чтобы образовать достаточное число клеток, необходимое для полноценного закрытия дефекта. В нормальных условиях пролиферативный пул эндотелиальных клеток не превышает 0,1-0,3 %. При активации пролиферации доля делящихся клеток в зоне репарации эндотелиального пласта может возрастать в 10-100 раз. Мы можем видеть, что примерно половина клеток, видимых на этой фотографии, находится в S-фазе или прошли ее. Ядра остальных клеток #1, #2, #3 не содержат 3Н-тимидин. В данном примере была использована так называемая "импульсная метка" - введение радиоактивного предшественника в течение короткого (несколько минут) интервала времени и последующая фиксация материала. Такой подход еще не свидетельствует о величине общего пролиферативного пула, но зато позволяет проследить дальнейшую судьбу клеток, ядра которых успели включить 3Н-тимидин в течение этого интервала.